Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLAMF1Q13291 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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