Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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TRAF1Q13077 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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TRAF1Q13077 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
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TRAF1Q13077 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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TRAF1Q13077 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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TRAF1Q13077 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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TRAF1Q13077 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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TRAF1Q13077 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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TRAF1Q13077 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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TRAF1Q13077 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF1Q13077 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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