Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NFX1Q12986 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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