Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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PTPN13Q12923 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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PTPN13Q12923 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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PTPN13Q12923 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
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