Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK18Q07002 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms