Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms