Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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SH3BP2P78314 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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SH3BP2P78314 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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SH3BP2P78314 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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SH3BP2P78314 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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SH3BP2P78314 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2P78314 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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