Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRKAA2P54646 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKAA2P54646 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms