Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSMB4P28070 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms