Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSSP25774 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSSP25774 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSSP25774 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSSP25774 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSSP25774 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSSP25774 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSSP25774 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSSP25774 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSSP25774 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSSP25774 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSSP25774 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSSP25774 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSSP25774 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSSP25774 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSSP25774 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSSP25774 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSSP25774 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CTSSP25774 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSSP25774 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSSP25774 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSSP25774 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSSP25774 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSSP25774 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSSP25774 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSSP25774 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSSP25774 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSSP25774 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSSP25774 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSSP25774 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSSP25774 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSSP25774 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSSP25774 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSSP25774 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSSP25774 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSSP25774 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSSP25774 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSSP25774 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTSSP25774 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CTSSP25774 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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CTSSP25774 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTSSP25774 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTSSP25774 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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CTSSP25774 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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CTSSP25774 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTSSP25774 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CTSSP25774 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTSSP25774 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTSSP25774 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTSSP25774 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTSSP25774 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CTSSP25774 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTSSP25774 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTSSP25774 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTSSP25774 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTSSP25774 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTSSP25774 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTSSP25774 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTSSP25774 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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