Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 C1orf132-204ENST00000637970 1170 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB3P14651 PSG5-207ENST00000407568 1064 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms