Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms