Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ITGAVP06756 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGAVP06756 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.9 ms