Protein–RNA interactions for Protein: O60941

DTNB, Dystrobrevin beta, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTNBO60941 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DTNBO60941 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTNBO60941 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTNBO60941 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTNBO60941 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTNBO60941 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTNBO60941 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTNBO60941 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTNBO60941 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DTNBO60941 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTNBO60941 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTNBO60941 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTNBO60941 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTNBO60941 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTNBO60941 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DTNBO60941 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTNBO60941 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTNBO60941 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTNBO60941 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DTNBO60941 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTNBO60941 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTNBO60941 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTNBO60941 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DTNBO60941 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTNBO60941 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTNBO60941 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTNBO60941 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DTNBO60941 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTNBO60941 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTNBO60941 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTNBO60941 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTNBO60941 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTNBO60941 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTNBO60941 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTNBO60941 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTNBO60941 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTNBO60941 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTNBO60941 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTNBO60941 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTNBO60941 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTNBO60941 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTNBO60941 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTNBO60941 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTNBO60941 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTNBO60941 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTNBO60941 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTNBO60941 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTNBO60941 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTNBO60941 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTNBO60941 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTNBO60941 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTNBO60941 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DTNBO60941 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms