Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms