Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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