Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM3Q9BZL3 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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