Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms