Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms