Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms