Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCAF4Q8WV16 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 697 ms