Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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SNX20Q7Z614 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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SNX20Q7Z614 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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SNX20Q7Z614 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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SNX20Q7Z614 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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SNX20Q7Z614 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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