Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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LINC00299Q6ZSB3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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LINC00299Q6ZSB3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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LINC00299Q6ZSB3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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LINC00299Q6ZSB3 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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LINC00299Q6ZSB3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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LINC00299Q6ZSB3 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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LINC00299Q6ZSB3 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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LINC00299Q6ZSB3 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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LINC00299Q6ZSB3 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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LINC00299Q6ZSB3 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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LINC00299Q6ZSB3 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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LINC00299Q6ZSB3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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