Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC36A4Q6YBV0 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms