Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 ADAMTS9-210ENST00000498707 7624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms