Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms