Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms