Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms