Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms