Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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