Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms