Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
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NTRK3Q16288 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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NTRK3Q16288 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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NTRK3Q16288 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NTRK3Q16288 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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