Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA6Q15825 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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