Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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