Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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GTF2H2Q13888 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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GTF2H2Q13888 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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GTF2H2Q13888 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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GTF2H2Q13888 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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GTF2H2Q13888 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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GTF2H2Q13888 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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GTF2H2Q13888 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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GTF2H2Q13888 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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GTF2H2Q13888 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GTF2H2Q13888 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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