Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf61Q13536 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms