Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms