Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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SKP2Q13309 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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SKP2Q13309 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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SKP2Q13309 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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SKP2Q13309 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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SKP2Q13309 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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SKP2Q13309 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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SKP2Q13309 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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SKP2Q13309 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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SKP2Q13309 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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SKP2Q13309 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
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