Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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CBX3Q13185 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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CBX3Q13185 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CBX3Q13185 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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