Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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GPS1Q13098 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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GPS1Q13098 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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GPS1Q13098 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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GPS1Q13098 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GPS1Q13098 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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