Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BNIP3Q12983 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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