Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
STX4Q12846 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
STX4Q12846 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
STX4Q12846 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
STX4Q12846 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
STX4Q12846 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
STX4Q12846 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
STX4Q12846 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
STX4Q12846 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
STX4Q12846 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
STX4Q12846 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
STX4Q12846 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
STX4Q12846 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
STX4Q12846 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
STX4Q12846 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
STX4Q12846 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
STX4Q12846 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
STX4Q12846 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
STX4Q12846 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
STX4Q12846 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
STX4Q12846 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
STX4Q12846 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
STX4Q12846 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
STX4Q12846 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
STX4Q12846 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
STX4Q12846 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
STX4Q12846 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
STX4Q12846 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
STX4Q12846 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
STX4Q12846 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
STX4Q12846 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
STX4Q12846 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
STX4Q12846 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
STX4Q12846 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
STX4Q12846 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
STX4Q12846 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
STX4Q12846 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
STX4Q12846 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
STX4Q12846 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
STX4Q12846 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
STX4Q12846 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
STX4Q12846 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
STX4Q12846 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
STX4Q12846 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
STX4Q12846 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
STX4Q12846 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
STX4Q12846 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
STX4Q12846 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
STX4Q12846 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
STX4Q12846 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
STX4Q12846 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
STX4Q12846 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
STX4Q12846 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
STX4Q12846 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
STX4Q12846 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
STX4Q12846 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
STX4Q12846 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms