Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC173Q0VFZ6 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms