Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms