Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DEUP1Q05D60 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms