Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARID5AQ03989 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms