Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SIM1P81133 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIM1P81133 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIM1P81133 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIM1P81133 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIM1P81133 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIM1P81133 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIM1P81133 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIM1P81133 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIM1P81133 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIM1P81133 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIM1P81133 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIM1P81133 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIM1P81133 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIM1P81133 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIM1P81133 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIM1P81133 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIM1P81133 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIM1P81133 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SIM1P81133 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIM1P81133 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIM1P81133 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIM1P81133 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIM1P81133 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SIM1P81133 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIM1P81133 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIM1P81133 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIM1P81133 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIM1P81133 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIM1P81133 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIM1P81133 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIM1P81133 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SIM1P81133 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIM1P81133 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms