Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SH3BP2P78314 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms