Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCCD1P59942 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms