Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTPAP49638 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTPAP49638 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTPAP49638 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TTPAP49638 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTPAP49638 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTPAP49638 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTPAP49638 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTPAP49638 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTPAP49638 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TTPAP49638 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTPAP49638 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTPAP49638 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTPAP49638 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTPAP49638 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTPAP49638 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTPAP49638 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTPAP49638 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTPAP49638 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTPAP49638 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTPAP49638 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTPAP49638 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTPAP49638 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTPAP49638 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTPAP49638 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTPAP49638 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTPAP49638 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTPAP49638 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTPAP49638 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTPAP49638 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTPAP49638 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTPAP49638 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTPAP49638 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTPAP49638 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TTPAP49638 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTPAP49638 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTPAP49638 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTPAP49638 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTPAP49638 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTPAP49638 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTPAP49638 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTPAP49638 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTPAP49638 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTPAP49638 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTPAP49638 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTPAP49638 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTPAP49638 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTPAP49638 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTPAP49638 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTPAP49638 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTPAP49638 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTPAP49638 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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